대한불교조계종 제16교구 본산인 고운사의 말사이다. 이 절은 870년(경문왕 10) 두운조사(杜雲祖師)가 창건했다.
〈사적기 寺蹟記〉에 의하면 936년 태조가 직접 중건했고, 1165년(의종 19) 왕명으로 중수했다고 한다.
1171년(명종 1) 태자의 태를 일주문 밖 자비봉두에 묻은 다음 절 이름을 용문산 창기사(昌基寺)라고 바꾸었고,
1179년부터 15년간에 걸쳐 대대적인 불사가 이루어졌다. 1478년(성종 9) 세종대왕의 비인 소헌왕후(昭憲王后)의
태실을 봉안하고, 절 이름을 성불산 용문사라고 다시 바꾸었다.
1783년(정조 7) 문효세자(文孝世子)의 태실을 이곳에 쓰고 성불산을 소백산으로 고쳤다.
1835년(헌종 1) 화재로 소실된 것을 역파(櫟坡)대사가 상민(尙敏)·부열(富悅) 등과 함께 중건했다.
현존 당우로는 보광명전·대웅전·응향각(凝香閣)·응진각·명부전·응진전·회전문·범종루 등이 있다.
중요문화재로는 대웅전(보물 제145호)·윤장대(輪藏臺：보물 제684호)·용문사교지(보물 제729호)가 있고,
강희23년(康熙二十三年) 명문이 있는 대장전목각불탱(보물 제989호) 등이 있다
